המכון לארכיאולוגיה מכליל בתוכו מספר מעבדות העובדות בקדמת המחקר הארכיאולוגי בתחומים הארכיאובוטניקה, הארכיאוזואולוגיה, והמיקרוארכיאולוגיה. כל מעבדה מנוהלת על ידי איש או אשת סגל מהמכון לארכיאולוגיה, ובמעבדות גם זוכים לעבוד סטודנטים העוסקים בתחומי המחקר הרלוונטיים. למידע נוסף עבור המעבדות, לחצו כאן.