שיתופי פעולה
למכון כהן שיתופי פעולה אקדמיים עם מוסדות ומכונים באוניברסיטאות שונות ברחבי הארץ ועם מוסדות מובילים בתחומם בעולם:
Boston Center for Philosophy and History of Science
Max Planck Institute for History of Science, Berlin.
Center for the History of Knowledge, ETH Zürich
בארץ, המכון מקיים קשרי מחקר ותוכניות מחקר עם המוסדות הבאים:
The Van Leer Institute in Jerusalem
History and Philosophy of Science Program at Bar-Ilan University
בנוסף, המכון עובד בצמוד עם מרכז מינרבה למדעי הרוח באוניברסיטת תל אביב. שיתופי הפעולה הללו מולידים סדנאות וסמינרים רבים, לרבות הסדנה הבינלאומית השנתית על ההיסטוריה והפילוסופיה של המדע שהינה פרי שיתוף הפעולה של מכון ון-ליר בירושלים, מרכז אדלשטיין ומכון כהן.